Comparação de genomas de espécies de Phyllosticta associadas a Citros

‘O gênero Phyllosticta compreende diversas espécies fitopatogênicas responsáveis por sintomas como manchas em folhas e frutos em diversos hospedeiros, e também apresenta espécies endofíticas e saprofíticas. Com a recente descrição de P. paracapitalensis e P. paracitricarpa, oito espécies de Phyllosticta agora são descritas em associação com hospedeiros cítricos, tanto como patógenos quanto endófitos, apresentando diferentes tipos de interação e modos de vida. Como este tipo de variação nos processos de interação com o hospedeiro existe em espécies tão filogeneticamente relacionadas, estas espécies de Phyllosticta são um excelente modelo para estudos evolutivos visando um melhor entendimento da evolução de fitopatógenos, bem como para estudos funcionais com novos genes candidatos.

Embora progressos significativos tem sido obtidos para a compreensão do gênero Phyllosticta como um todo, muitas questões ainda permanecem em aberto. Embora espécies patogênicas tenham sido descritas causando Citrus Tan Spot, apenas P. citricarpa é descrita como agente causal da Mancha Preta dos Citros. Estas diferenças em termos biológicos e ecológicos nas espécies de Phyllosticta associadas a Citros ainda não foram abordadas sob uma perspectiva genômica e evolutiva. Este tipo de abordagem será útil para investigar e compreender os processos biológicos envolvidos com os diferentes tipos de associação que as espécies desenvolvem com os hospedeiros cítricos. Além disso, estas análises podem auxiliar a identificar características e adaptações específicas em algumas das espécies, e características que expliquem a patogencidade de P. citricarpa.

Como os genomas das espécies de Phyllosticta associadas a Citros agora estão disponíveis (com exceção de P. paracapitalensis), agora é possível realizar análises comparativas para compreender as diferenças funcionais e evolutivas entre as espécies. Sendo assim, o principal objetivo desde projeto é realizar análises de genômica comparativa para as espécies de Phyllosticta associadas à Citros, focando na evolução da patogenicidade em P. citricarpa. O principal interesse é na evolução do genoma e na evolução dos genes de patogenicidade, com ênfase na identificação de assinaturas de seleção positiva, e na relação entre estas assinaturas com a patogenicidade de P. citricarpa. Os resultados servirão de bases para abordagens funcionais envolvendo a deleção/silenciamento de genes candidatos e análises de expressão gênica, para validar os resultados e avaliar o envolvimento de genes sob seleção positiva na patogenicidade.

Este projeto está sendo conduzido no Laboratório de Bioprospecção e Genética Molecular de Microrganismos (BioGeMM) na UFPR sob supervisão da Prof. Chirlei Glienke e no Instuto Max Planck de Biologia Evolutiva em Ploen, na Alemanha, no grupo de Genômica Ambiental e sob supervisão da Profª Eva Stukenbrock. Colaboradores adicionais incluem o Prof. Marcos Machado do IAC (Instituto Agronômico de Campinas, Brasil), Prof. Pedro Crous e Prof. Ewald Groenewald (Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, na Holanda).’